O Pilates Clínico é uma modificação do método do Pilates Tradicional e foi criado pela APPI©(Australian Physiotherapy & Pilates Institute), que é o único instituto da Europa a promover o Pilates específico para fisioterapeutas. A modificação da técnica consiste na adaptação e abolição de alguns exercícios que causam sobrecargas excessivas ou compensações indevidas sobre a coluna vertebral.

O Pilates Clínico tem por objetivo retreinar a estabilização segmentar dinâmica da coluna, reabilitando e condicionando os músculos profundos estabilizadores (transverso do abdômen e multifido), que perdem sua função durante um quadro de dor ou lesão local. Dessa forma, o Pilates Clinico trata com eficiência a dor lombar e cervical aguda ou crônica, protusões discais (herniações), como também, nos processos de reabilitação pós-operatória.

O Pilates Clínico tem por objetivo a reeducação postural de uma forma mais dinâmica, rápida e prazerosa, ao contrário da técnica do RPG, que é estática pelo uso de posturas globais. O Pilates Clínico atua de forma específica e individualizada, pois cada paciente tem o seu mecanismo de compensação diante das alterações da coluna vertebral.

Para um resultado mais rápido e efetivo, os exercícios terapêuticos são utilizados para devolver a funcionalidade específica do indivíduo, de acordo com a solicitação corporal que ele necessita, seja nas atividades de vida diária ou nas práticas esportivas.

O uso do Pilates no tratamento das disfunções, como por exemplo da coluna vertebral, torna o tratamento individualizado, proporcionando uma reabilitação dinâmica, mais rápida e com resultados duradouros, além de ser uma excelente ferramenta para a prevenção de lesões e compensações inadequadas, especialmente para esportistas e os praticantes de atividade física regular.